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EGFR T790M突變檢測的技術進展
時間:2017-08-15   作者:AZD9291 【轉載】   

  奧希替尼是一種不可逆的三代EGFR-TKI,可以選擇性地抑制EGFR敏感突變和T790M突變。2017年3月,奧希替尼在華上市,開創了EGFR TKI耐藥后T790M陽性患者的精準治療新時代。隨著泰瑞沙的上市,如何敏感、準確地檢測T790M突變成為臨床關注的熱點。為此分別從以下4個方面進行系統梳理:EGFR T790M檢測的重要性、檢測標本的選擇、檢測方法學比較,以及血漿動態監測的價值。國際、國內的權威指南均推薦,所有EGFR TKI耐藥后的患者,都應該進行T790M突變檢測。那么應該采用何種方法進行T790M突變檢測呢?本文將詳細為您解答。

  泰瑞沙在華上市,拉開了T790M突變患者精準治療新時代。指南推薦,對于EGFR-TKI耐藥的患者,都進行T790M突變檢測;組織活檢是目前T790M突變檢測的標準方法。對于部分無法取樣的患者,可以嘗試采用細胞學標本(如惡性胸水),血液標本(ctDNA)和尿液標本(ctDNA)作為補充手段。那么,目前T790M突變檢測,我們有哪些檢測方法呢?T790M突變檢測主要分為3類:1. 非數字化ARMS法:如FDA批準的泰瑞沙伴隨診斷Cobas® EGFR突變檢測試劑盒V2(羅氏,石蠟組織切片和血漿);艾德ADx®-ARMS(石蠟組織切片)、Super-ARMS(血漿);和凱杰Therascreen EGFR kit/plasma RGQ PCR kit。2. 數字化PCR:常見的有賽默飛QuantStudioTM3D數字PCR系統;伯樂微滴式數字PCR;BEAMing數字PCR。3. 下一代測序技術,主要包括:Illumina和Ion Torrent(賽默飛)。

  (一)EGFR突變檢測的伴隨診斷平臺

  目前,已經有多個基于PCR檢測的診斷平臺用于EGFR突變檢測,包括cobas法、ARMS法、BEAMing法、數字PCR法、HRM法、DHPLC法、質譜分析基因分型、電場誘導釋放與測量法(EFIRM)和二代測序(NGS)。以下總結了最常用的檢測平臺的主要性能。

  (二)EGFR T790M突變檢測的技術比較

  上期我們提到目前國際、國內的權威指南推薦,應優先進行組織檢測。(上期回顧:EGFR-TKI耐藥后的檢測標本選擇:組織活檢vs.液體活檢)

  面對眾多的檢測平臺,組織檢測該選擇何種方法呢?在奧希替尼的I期擴展隊列中,中心實驗室采用羅氏Cobas組織檢測,EGFR T790M的陽性率為62%(138/222)。在三代EGFR TKI Rociletinib I-II期研究中,中心實驗室采用羅氏Cobas組織檢測或凱杰Therascreen,EGFR T790M的陽性率為53%(78/148)。EGFR-TKI耐藥后患者再行組織檢測,大部分采用的是活檢穿刺的小標本,由于樣本量較小且組織存在異質性,推薦采用較敏感的ARMS法,比如經過臨床試驗驗證的Cobas。近年來,開發出一些高敏感度的檢測方法,但進行組織檢測時,需要警惕假陽性的可能。

  當組織樣本不可及時,需要考慮其他樣本比如血漿作為替代。目前血漿T790M突變檢測的不同方法敏感性及特異性各有不同。Thress等人的研究對比了cobas法、BEAMing法、數字PCR法和ARMS法,結果顯示在T790M突變檢測上,數字檢測平臺的敏感度優于非數字檢測法。在臨床上,數字PCR能實現絕對定量,這是優于qPCR法的相對定量的,尤其是對于低豐度突變。在數字PCR對比ARMS法的研究中發現,數字PCR法的T790M突變率更高,分別為43.0%和25.2%,數字PCR法的檢測下限為0.03%。另一個研究比較了NGS和cobas法對血漿中EGFR突變(EGFR exon19del,L858R和T790M突變)的定量檢測,發現這兩種方法存在較強的相關性(R2>95%, P<0.0001。因此,如果采用血漿進行T790M突變檢測,推薦采用靈敏度相對較高的數字PCR或NGS平臺。下表2,3總結了采用不同血漿檢測平臺進行EGFR T790M突變檢測。

  對于EGFR TKI耐藥的患者,應優先采用組織檢測,推薦使用ARMS方法。但如果患者進行血漿T790M檢測,推薦采用靈敏度相對較高的數字PCR或NGS平臺,對于血漿檢測T790M陰性的患者,應該再行組織檢測加以驗證。

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